跨种族全基因组分析激素敏感的儿童肾病

HannaDebiec,ClaireDossier,EricLetouzé,ChristopherE.Gillies,MarinaVivarelli,RosemaryK.Putler,ElisabetArs,EvelyneJacqz-Aigrain,10ValeryElie,10ManuelaColucci,StéphanieDebette,PhilippeAmouyel,SihamC.Elalaoui,AbdelazizSefiani,ValérieDubois,TabassomeSimon,MatthiasKretzler,JoseBallarin,FrancescoEmma,MatthewG.Sampson,GeorgesDeschênes,PierreRonco

本刊负责人:郭志勇海军医院

审校:医院北院

翻译:医院

摘要

背景:激素敏感的肾病综合征(steroid-sensitivenephroticsyndrome,SSNS)是儿童常罹患的疾病,其病理生理机制和基因构架目前还不清楚。我们通过在欧洲招募患儿和以肾活检为基础的北美NEPTUNE队列研究调查了SSNS儿童的基因背景。

方法:本研究在相匹配的三个不同种族名肾病综合征患儿(儿童肾病和病毒队列研究中包括名欧洲人、56名非洲人及85名马格里布人)进行了全基因组关联分析(genome-wideassociationstudies,GWAS),其后又对名欧洲儿童进行了独立的验证,包括跨种族荟萃分析和条件分析。GWAS分析的等位基因在NEPTUNE队列39名儿童中进行了肾小球顺式表达定量定位以及特性研究,并在GWAS和NEPTUNE队列97名患儿中进行了流行病学调查。

结果:跨种族荟萃分析识别出在HLA-DQB1的3‘非编码区域存在一个与SSNS相关的单核苷酸多态性位点(single-nucleotidepolymorphism,SNP)rs(P=9.3×10-23)。条件分析也得到另外两个独立风险等位基因,一个在HLA-DRB1上游(rs,P=3.7×10-11),另一个在BTNL2的3’非编码区域(rs,P=9.4×10-7),内含子HCG23和LOC之间。这三个风险等位基因是独立于在欧洲患者中证实的风险单倍体DRB1*07:01-DQA1*02:01-DQB1*02:02的。在独立位点上增加风险等位基因的负荷与SSNS的较高发生率相关。在独立位点上增加风险等位基因的负荷除了与SSNS的较高发生率相关,还和所有队列中患儿发病年龄更早,以及NEPTUNE患儿组织学上完全缓解率增加有关。SNP位点rs和HLA-DRB1、HLA-DRB5和HLA-DQB1肾小球内表达下降相关。

结论:跨种族的GWAS研究是我们能发现与儿童SSNS相关的三个独立的风险SNPs。这些SNPs的表征特点为明确肾病综合征免疫失调的机制提供了切入点,也提供了一种疾病基因分级方法。

JAmSocNephrol29:–,

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